package jspecview.dialog;
//
//import java.util.Hashtable;
//import java.util.Map;
//
//import javajs.util.Parser;
//import org.jmol.util.Txt;
//
//import jspecview.api.AnnotationData;
//import jspecview.api.JSVPanel;
//import jspecview.common.Coordinate;
//import jspecview.common.IntegralData;
//import jspecview.common.JSViewer;
//import jspecview.common.MeasurementData;
//import jspecview.common.PanelData;
//import jspecview.common.Parameters;
//import jspecview.common.PeakData;
//import jspecview.common.Annotation.AType;
//import jspecview.source.JDXSpectrum;

/**
 * DialogParams handles all the platform-independent 
 * needs of AwtAnnotationDialog and subclasses of it. 
 * 
 * 
 * @author hansonr
 *
 */
public class DialogParams {
//	
//	public String getThreasholdText(double y) {
//		if (Double.isNaN(y)) {
//			PanelData pd = jsvp.getPanelData();
//			double f = (pd.getSpectrum().isInverted() ? 0.1 : 0.9);
//			Coordinate c = pd.getClickedCoordinate();
//			y = (c == null ? (pd.getView().minYOnScale * f + pd.getView().maxYOnScale)
//					* (1 - f)
//					: c.getYVal());
//		}
//		String sy = Txt.formatDecimalDbl(y, y < 1000 ? 2 : -2); // "#0.00" :
//																														// "0.00E0"
//		return " " + sy;
//	}
//
//	public MeasurementData getPeakData() {
//		PeakData md = new PeakData(AType.PeakList, spec);
//		md.setPeakList(myParams, precision, jsvp.getPanelData().getView());
//		xyData = md;
//		return null;
//	}
//
//	public void setup() {
//		subType = (spec == null ? "" : spec.getTypeLabel());
//		thisKey = type + "_" + subType;
//		if (spec == null)
//			return;
//		myOptions = (Object[]) options.get(thisKey);
//		options = new Hashtable<String, Object>();
//		if (myOptions == null)
//			options.put(thisKey, myOptions = spec.getDefaultAnnotationInfo(type));
//		unitOptions = (String[]) myOptions[0];
//		formatOptions = (int[]) myOptions[1];
//		unitPtr = (Integer) options.get(thisKey + "_unitPtr");
//		if (unitPtr == null)
//			unitPtr = (Integer) myOptions[2];
//	}
//
//	public boolean checkVisible() {
//		return viewer.selectedPanel.getPanelData().getShowAnnotation(type);
//	}
//
//	public void getUnitOptions() {
//		String key = thisKey + "_format";
//		Integer format = (Integer) options.get(key);
//		if (format == null)
//			options.put(key, format = Integer
//					.valueOf(formatOptions[unitPtr == null ? 0 : unitPtr.intValue()]));
//		// txtFormat = dialogHelper.addInputOption("numberFormat", "Number Format",
//		// format, null, null, false);
//	}
//	
//	public boolean skipCreate;
//
//	public void eventApply() {
//		switch (type) {
//		case Integration:
//			break;
//		case Measurements:
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//		case PeakList:
//			createData();
//			skipCreate = true;
//			break;
//		case OverlayLegend:
//			break;
//		case Views:
//			break;		
//		}
//		annDialog.applyFromFields();
//	}
//
//	public void eventShowHide(boolean isShow) {
//		isON = isShow;
//		if (isShow)
//			eventApply();
//		jsvp.doRepaint();
//		annDialog.checkEnables();
//	}
//	
//	public void apply(Object[] objects) {
//		try {
//			switch (type) {
//			case Integration:
//				double offset = Double.parseDouble((String) objects[0]);
//				double scale = Double.parseDouble((String) objects[1]);
//				myParams.integralOffset = offset;
//				myParams.integralRange = scale;
//				myParams.integralDrawAll = false;// chkResets.isSelected();
//				((IntegralData) getData()).update(myParams);
//				jsvp.doRepaint();
//				break;
//			case Measurements:
//				// n/a
//				break;
//			case NONE:
//				return;
//			case PeakList:
//				if (!skipCreate) {
//					annDialog.setThreshold(Double.NaN);
//					createData();
//				}
//				skipCreate = false;
//				break;
//			case OverlayLegend:
//				break;
//			case Views:
//				break;
//			}
//			annDialog.loadDataFromFields();
//			annDialog.checkEnables();
//			jsvp.doRepaint();
//		} catch (Exception e) {
//			// ignore
//		}
//	}
//
//	public void clear() {
//		if (xyData != null) {
//			xyData.clear();
//			annDialog.applyFromFields();
//		}
//	}
//
//	public void done() {
//		if (jsvp != null && spec != null)
//			jsvp.getPanelData().removeDialog(annDialog);
//		// setState(false);
//		if (xyData != null)
//			xyData.setState(isON);
//		annDialog.saveDialogPosition(annDialog.getPosXY());
//		annDialog.dispose();
//		jsvp.doRepaint();
//	}
//
//	public void reEnable() {
//		switch (type) {
//		case Integration:
//			break;
//		case Measurements:
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//		case PeakList:
//			skipCreate = true;
//			break;
//		case OverlayLegend:
//			break;
//		case Views:
//			break;
//		}
//		annDialog.setVisible(true);
//		isON = true;
//		annDialog.applyFromFields();
//	}
//
//	public MeasurementData getData() {
//		if (xyData == null)
//			createData();
//		return xyData;
//	}
//
//	public void setData(AnnotationData data) {
//		myParams = data.getParameters();
//		xyData = (MeasurementData) data;
//	}
//
//	public void setSpecShift(double dx) {
//		if (xyData != null)
//			xyData.setSpecShift(dx);
//	}
//
//	public int iRowSelected = -1;
//	public int iColSelected = -1;
//	public int iRowColSelected = -1;
//
//	private int iSelected = -1;
//
//	public void setType(AType type) {
//		this.type = type;
//		switch (type) {
//		case Measurements:
//			addUnits = true;
//			break;
//		case Integration:
//			break;
//		case PeakList:
//			break;
//		case OverlayLegend:
//			break;
//		case Views:
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//
//		}
//	}
//
//	public void tableCellSelect(int iRow, int iCol) {
//		Object value = tableData[iRow][1];
//		int icolrow = iRowSelected * 1000 + iColSelected;
//		if (icolrow == iRowColSelected)
//			return;
//		iRowColSelected = icolrow;
//		annDialog.selectTableRow(iRowSelected);
//		try {
//			switch (type) {
//			case Integration:
//				for (int i = 0; i < xyData.size(); i++)
//					if (Txt.formatDecimalDbl(xyData.get(i).getXVal(), 2).equals(value)) {
//						iSelected = i;
//						jsvp.getPanelData().setXPointers(spec, xyData.get(i).getXVal(),
//								spec, xyData.get(i).getXVal2());
//						jsvp.doRepaint();
//						break;
//					}
//				annDialog.checkEnables();
//				break;
//			case Measurements:
//				break;
//			case NONE:
//				break;
//			case PeakList:
//				try {
//					switch (iCol) {
//					case 6:
//					case 5:
//					case 4:
//						double x1 = Double.parseDouble((String) value);
//						double x2 = Double.parseDouble((String) tableData[iRow + 3 - iCol][1]);
//						jsvp.getPanelData().setXPointers(spec, x1, spec, x2);
//						break;
//					default:
//						jsvp.getPanelData().findX(spec, Double.parseDouble((String) value));
//					}
//				} catch (Exception e) {
//					jsvp.getPanelData().findX(spec, 1E100);
//				}
//				jsvp.doRepaint();
//				break;
//			case OverlayLegend:
//				jsvp.getPanelData().setSpectrum(iRow, false);
//				break;
//			case Views:
//				break;
//			}
//		} catch (Exception e) {
//			// for parseDouble
//		}
//	}
//
//	public void loadData(Object param) {
//		Object[][] data;
//		String[] header;
//		int[] widths;
//		switch (type) {
//		case Integration:
//			if (xyData == null)
//				createData();
//			iSelected = -1;
//			data = ((IntegralData) xyData).getMeasurementListArray(null);
//			header = xyData.getDataHeader();
//			widths = new int[] { 40, 65, 65, 50 };
//			annDialog.createTable(data, header, widths);
//			break;
//		case Measurements:
//			if (xyData == null)
//				return;
//			data = xyData.getMeasurementListArray(param.toString());
//			header = xyData.getDataHeader();
//			widths = new int[] { 40, 65, 65, 50 };
//			annDialog.createTable(data, header, widths);
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//		case PeakList:
//			if (xyData == null)
//				createData();
//			data = ((PeakData)xyData).getMeasurementListArray(null);
//			header = ((PeakData)xyData).getDataHeader();
//			widths = new int[] {40, 65, 50, 50, 50, 50, 50};
//			annDialog.createTable(data, header, widths);
//			annDialog.setTableSelectionEnabled(true);
//			break;
//		case OverlayLegend:
//			header = new String[] { "No.", "Plot Color", "Title" };
//			data = viewer.selectedPanel.getPanelData().getOverlayLegendData();
//			widths = new int[] {30, 60, 250};
//			annDialog.createTable(data, header, widths);
//			annDialog.setTableSelectionEnabled(true);
//			break;
//		case Views:
//			break;
//		}
//	}
//
//	public void update(Coordinate clicked, double xRange, int yOffset) {
//		annDialog.selectTableRow(-1);
//		switch (type) {
//		case Integration:
//			annDialog.loadDataFromFields();
//			annDialog.checkEnables();
//			break;
//		case Measurements:
//			annDialog.loadDataFromFields();
//			annDialog.checkEnables();
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//		case PeakList:
//			if (yOffset > 20)
//				annDialog.applyFromFields();
//			if (xyData == null || clicked == null || yOffset > 20)
//				return;
//			int ipt = 0;
//			double dx0 = 1e100;
//			double xval = clicked.getXVal();
//			PeakData md = (PeakData) xyData;
//			double min = Math.abs(xRange / 20);
//			for (int i = md.size(); --i >= 0;) {
//				double dx = Math.abs(xval - md.get(i).getXVal());
//				if (dx < dx0) {
//					dx0 = dx;
//					ipt = i;
//				}
//			}
//			if (dx0 < min) {
//				annDialog.selectTableRow(md.size() - 2 - ipt);
//				annDialog.repaint();
//			}
//			break;
//		case OverlayLegend:
//			break;
//		case Views:
//			break;
//		}
//	}
//
//	public void createData() {
//		switch (type) {
//		case Integration:
//			xyData = new IntegralData(spec, myParams);
//			iSelected = -1;
//			break;
//		case Measurements:
//			// n/a
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//		case PeakList:
//			annDialog.setParamsFromFields();
//			PeakData md = new PeakData(AType.PeakList, spec);
//		  md.setPeakList(myParams, precision, jsvp.getPanelData().getView());
//			xyData = md;
//			annDialog.loadDataFromFields();
//			break;
//		case OverlayLegend:
//			break;
//		case Views:
//			break;
//		}
//	}
//
//	public void deleteIntegral() {
//		if (!checkSelectedIntegral())
//			return;
//		xyData.remove(iSelected);
//		iSelected = -1;
//		iRowColSelected = -1;
//		annDialog.applyFromFields();
//		jsvp.doRepaint();
//	}
//
//	public boolean checkSelectedIntegral() {
//		if (iSelected < 0) {
//			annDialog
//					.showMessage("Select a line on the table first, then click this button.", "Integration", DialogManager.INFORMATION_MESSAGE);
//			return false;
//		}
//		return true;
//	}
//
//	public double lastNorm = 1;
//	public double lastMin = 0;
//
//	public void processEvent(String what, double val) {
//		switch (type) {
//		case Integration:
//			if (what.equals("min")) {
//				((IntegralData) xyData).setMinimumIntegral(lastMin = val);
//			} else if (what.equals("int")) {
//				if (val < 0)
//					return;
//				((IntegralData) xyData).setSelectedIntegral(xyData.get(iSelected),
//						lastNorm = val);
//			}
//			break;
//		case Measurements:
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//		case PeakList:
//			break;
//		case OverlayLegend:
//			break;
//		case Views:
//			break;
//		}
//		annDialog.applyFromFields();
//		jsvp.doRepaint();
//	}
//
//	public void setFields() {
//		switch (type) {
//		case Integration:
//			break;
//		case Measurements:
//			break;
//		case NONE:
//			break;
//		case PeakList:
//			myParams = xyData.getParameters();
//			annDialog.setThreshold(myParams.peakListThreshold);
//			annDialog.setComboSelected(myParams.peakListInterpolation.equals("none") ? 1 : 0);
//			createData();
//			break;			
//		case OverlayLegend:
//			break;
//		case Views:
//			break;
//		}
//	}
//
//	public void setParams(Object[] objects) {
//		try {
//			switch (type) {
//			case Integration:
//				break;
//			case Measurements:
//				break;
//			case NONE:
//				break;
//			case PeakList:
//				double thresh = Double.parseDouble((String) objects[0]);
//				myParams.peakListThreshold = thresh;
//				myParams.peakListInterpolation = (String) objects[1];
//				myParams.precision = precision;
//				break;
//			case OverlayLegend:
//				break;
//			case Views:
//				break;
//			}
//		} catch (Exception e) {
//			// for parseDouble
//		}
//	}
//
//	public void setPrecision(int i) {
//		precision = formatOptions[i];
//	}
//
//	public boolean runScript(String script) {
//		viewer.runScript(script);
//		return true;
//	}
//
//	public void tableSelect(DialogManager manager, String url) {
//		boolean isAdjusting = "true".equals(manager.getField(url, "adjusting"));
//		if (isAdjusting) {
//			iColSelected = iRowSelected = -1;
//			return;
//		}
//		int index = Parser.parseInt(manager.getField(url, "index"));
//		switch ("ROW COL ROWCOL".indexOf(manager.getField(url, "selector"))) {
//		case 8:
//			iColSelected = Parser.parseInt(manager.getField(url, "index2"));
//			//$FALL-THROUGH$
//		case 0:
//			iRowSelected = index;
//			break;
//		case 4:
//			iColSelected = index;
//			break;
//		}
//		if (iColSelected >= 0 && iRowSelected >= 0) {
//			tableCellSelect(iRowSelected, iColSelected);
//		}
//	}
}